在經過又一次的重啟后，被世界樹儲存起來的數據（數碼獸）再度放出，重新豐富起了[neo數碼世界]的生態，這里將形成新的平衡和秩序。
或許是原先的數碼世界太過錯綜復雜，又經歷過[new數碼世界]這個實驗場數據的收集后，[neo數碼世界]被安排了全新的，更合理的框架，混雜在一起的數碼獸們依據自己特性和生態特點得到了對應生態領域的劃分，比之[new數碼世界]多個終端分層的簡要劃分，更加完善——每個終端分層一個大區，一個大區里再分數個小區，看似互相隔開，卻又維持著聯系。
這一設計巧妙地在在保持了生態流動性的基礎上，預防了過于冗雜進化導致的數據爆炸，可以說，世界樹早就構筑好了全新數碼世界的框架，就等著一個契機重啟了。
無論是讓死x獸還是阿爾法獸來，區別也只是過程的不同，扳機終究會被扣下。
但這一切并非毫無意義，在阿爾法獸的努力下，更多的，本該被一起清除的數碼獸們活下來了，一同來到這全新天地里，得以重新開始。
努力活下來的數碼獸們，新孕育的數碼獸們，都同樣是生命，一無二致，接下來也會以一同生活下去吧。
不過這并不代表著結束，對于阿爾法獸來說，還有很多后續工作要處理。
在主機下線的這段空窗期，對數碼世界的管理，以及……關于皇家騎士團后續的處理。
雖然負責執行[方舟計劃]的只有奧米加獸，紅蓮騎士獸，金甲龍獸這三位，其他皇騎要么在執行任務要么有別的事（比如說時不時沉睡的龍帝艾克薩獸）不過對于這項計劃它們還是有所耳聞的，而關于阿爾法獸的出現以及其對世界樹的作為，就有些駭人聽聞了。
雖然皇家騎士只信奉自己形式的正義，也終究是效忠世界樹的，一些以忠義為自身信條的皇騎更是無法接受，要肅清叛逆者。
“那么就在這里一決勝負吧——由勝者來決定一切。”
以最簡要直接的方式，解決這無謂的爭端。
然后阿爾法獸就向它們展示了，何為皇家騎士抑制力的存在。
[最初獲取之力]
一瞬間，就將敵對者悉數擊倒。
“今后，我們會在需要的時候開放對世界樹的溝通途徑。”
雖然這不見得能把潛在的問題根治，但起碼……發生暴走的時候，還有機會去糾正。
畢竟數碼世界，需要的是管理者，而不是統治者。
將這一信息告知所有數碼獸后，阿爾法獸一直守候等到了主機的重啟。
“世界樹，你要注意對數碼獸們的過分干涉。”
“雖然當數碼世界再次遇到危機時，我會再回來的……但還是希望這種事情不要發生。”
留下這句話后，阿爾法獸就離開了。
而世界樹也在之后恢復了數碼世界與人類世界的聯系。
而數碼世界，也不再見他的蹤影……
或許正如他所說的，只有情況危急的時候，他才會再回來吧。
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